Объясняю...

Парсер переводит ВСЕ НЕ ЛАТИНСКИЕ символы в koi8-r перед занесением их в базу. И, соответственно, наоборот - при чтении из базы читает koi8-r.
Следовательно, если phpmyadmin "заточен по-гречески", он будет читать из базы напрямую, а парсер - с перекодировкой.

Как лечить:
проверить, есть ли в используемой версии ^sqldisableconvert[]. Если выполнение этого оператора прошло без ошибок - указывать его в начале - не будет этой перекодировки.
(введен с версии 168-sp4e, возможно, чуть раньше - но надо проверять. в просто sp4 его точно нет)