тогда и с мылом проблем не будет

Как ты представляешь себе размещение ответа в определенное место в треде?

Также как и сейчас - по времени и дате.

Например, тебе пришел ответ на твой месс в форуме и было-бы хорошо сделать так, чтобы ты нажав "Reply" в почтовом клиенте послал-бы в форум сообщение, которое встало-бы в нужное место.
Для этого нужно как-то передать в ответ айдишку сообщения, на которое отвечаем. Служебные поля в header-е письма не катат, т.к. могут быть изничтожены какими-нить мылерами, хранить это в теле можно, но как-то некрасиво, хотя работать будет...

А где не красиво? Если ты имеешь ввиду лишние символы в теле, то это не роялит, потому что возможность постить мылом намного эффективней.


И самое главное: что делать с аутентификацией?
Ведь любой сможет в принципе подделать заголовок...
Вот на это у меня пока решения нету.

А для чего он это будет делать?
Сейчас любой может подделать всё что угодно.
Но если аутентификация будет эффективно работать на странице, тогда и с мылом проблем не будет.