Берем cron и... ;-)

раз в 10 секунд мувим все из папки на www в папку на ftp ;-)
а уж средства мувения выбирай сам...

или напиши CGI, которы выполняй после аплоада, который будет открывать коннекцию с ftp, класть туды свеженький файл (имя и путь передается в параметрах) и закрывать коннекцию. ну и удалять по ненадобности...

еще вариантов ;-)))